MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 7026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	CTCA	2	8	1898	1905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015518	TAT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015518	AAT	2	6	3374	3379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015518	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015518	TTC	2	6	5562	5567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015518	TTA	2	6	6058	6063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015518	TCTT	2	8	6074	6081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015518	AAT	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015518	ATT	2	6	6129	6134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015518	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015518	ATG	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015518	GTATA	2	10	8537	8546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015518	T	6	6	8589	8594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015518	CTTG	2	8	8624	8631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015518	AGT	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015518	TAAG	2	8	8670	8677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015518	ATA	2	6	8709	8714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015518	CT	3	6	9563	9568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015518	A	6	6	9601	9606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015518	AAT	2	6	13732	13737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015518	TAGA	2	8	13825	13832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015518	TAT	3	9	13859	13867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015518	TAC	2	6	13897	13902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015518	TTC	2	6	13913	13918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015518	TTA	2	6	13930	13935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015518	CCT	2	6	13938	13943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015518	ATAGT	2	10	13975	13984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015518	TAAT	2	8	14047	14054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015518	AAGGT	2	10	14059	14068	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015518	TAA	2	6	14074	14079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015518	ATT	2	6	14145	14150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015518	TATAAT	2	12	14156	14167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015518	GGT	2	6	14169	14174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015518	TATT	2	8	14179	14186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015518	TCA	2	6	14800	14805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015518	ATT	3	9	14817	14825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015518	TCA	2	6	14845	14850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015518	A	6	6	15955	15960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015518	TGT	2	6	19916	19921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015518	T	6	6	20601	20606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015518	ATAAA	2	10	20607	20616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015518	AG	3	6	20618	20623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015518	TAA	2	6	20656	20661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015518	AACCT	2	10	20679	20688	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015518	TGA	2	6	20695	20700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015518	GTT	2	6	20704	20709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015518	CCT	2	6	20710	20715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015518	GATT	2	8	20716	20723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015518	TAT	2	6	20726	20731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015518	TA	3	6	20736	20741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015518	TTA	2	6	22163	22168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015518	TTA	2	6	22177	22182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015518	TGA	2	6	28511	28516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015518	AAT	2	6	28551	28556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015518	TA	3	6	31943	31948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015518	ACAA	2	8	31990	31997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015518	TAA	2	6	32251	32256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015518	TA	3	6	33957	33962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015518	GA	3	6	33967	33972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015518	TAA	2	6	34003	34008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015518	TATAA	2	10	34035	34044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015518	TAAA	2	8	34059	34066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015518	AAAGA	2	10	34071	34080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015518	ATAA	2	8	34082	34089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015518	ATTT	2	8	36571	36578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015518	AGT	2	6	36591	36596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015518	ATT	2	6	39002	39007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015518	TA	3	6	39024	39029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015518	ACT	2	6	39040	39045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015518	ATT	2	6	40103	40108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015518	AAT	2	6	40130	40135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015518	T	6	6	42447	42452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015518	TAG	2	6	42506	42511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015518	TAA	2	6	44307	44312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015518	AAAAT	2	10	46183	46192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015518	A	6	6	48455	48460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015518	TCT	2	6	48473	48478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015518	T	6	6	48480	48485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015518	CTT	2	6	49042	49047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015518	TTA	2	6	49053	49058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015518	TCAG	2	8	50380	50387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015518	TTCA	2	8	50399	50406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015518	CGTCA	2	10	50417	50426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015518	AACT	2	8	50435	50442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015518	AAC	2	6	50445	50450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015518	AAAAT	2	10	50455	50464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015518	TTA	2	6	51891	51896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015518	ATC	2	6	51906	51911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015518	TA	3	6	52705	52710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015518	TATG	2	8	52713	52720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015518	CA	3	6	52725	52730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015518	AAC	2	6	52731	52736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015518	TAA	2	6	52773	52778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015518	A	6	6	55088	55093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015518	TAA	2	6	55112	55117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015518	TAC	2	6	55141	55146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015518	AAG	2	6	55176	55181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015518	ATTTTT	2	12	55185	55196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015518	CCT	2	6	55206	55211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015518	AAT	2	6	58699	58704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015518	ATA	2	6	62003	62008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015518	ATT	2	6	62084	62089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015518	AAAG	2	8	62111	62118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015518	CTT	2	6	62198	62203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015518	ACT	2	6	62225	62230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015518	TAC	2	6	62257	62262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015518	ATAA	2	8	62290	62297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015518	CAT	2	6	62319	62324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015518	T	6	6	62374	62379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015518	T	7	7	62382	62388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015518	A	6	6	62416	62421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015518	A	6	6	62526	62531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015518	TA	3	6	62533	62538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015518	TCT	2	6	62540	62545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015518	AAG	2	6	62566	62571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015518	TCT	2	6	62624	62629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015518	CTG	2	6	62646	62651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015518	AGT	2	6	62678	62683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015518	TA	3	6	62715	62720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015518	GATT	2	8	62755	62762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015518	CCT	2	6	62780	62785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015518	TAAA	2	8	62855	62862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015518	AT	3	6	62863	62868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015518	ATG	2	6	62872	62877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015518	CTC	2	6	62993	62998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015518	CTT	2	6	63070	63075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015518	AAAT	2	8	63082	63089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015518	ATA	2	6	63104	63109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015518	ACT	2	6	63141	63146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015518	CTC	2	6	63163	63168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015518	TTCA	2	8	63216	63223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015518	ACT	2	6	63227	63232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015518	ATA	2	6	63272	63277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015518	TA	3	6	63283	63288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015518	TA	4	8	63290	63297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015518	T	6	6	64339	64344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015518	A	9	9	64345	64353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015518	GTCG	2	8	66593	66600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015518	A	6	6	66636	66641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015518	ATA	2	6	69710	69715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015518	TAT	2	6	70835	70840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015518	AT	3	6	71516	71521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015518	TA	3	6	71570	71575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015518	T	6	6	72955	72960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015518	ATTTT	2	10	73310	73319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015518	TAT	2	6	76576	76581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015518	ATC	2	6	77186	77191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015518	A	6	6	77201	77206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015518	AT	3	6	77273	77278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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